由汤富酬研究员研发的单细胞RNA-Seq转录组测序技术为深入探讨人类胚胎发育的神秘提供了新的技术路线。该研究团队应用该测序技术对处于不同发育阶段的早期胚胎的90个单细胞以及人类胚胎干细胞系(hESCs)的34个单细胞进行了详尽的分析,构建了世界上最完全的人类胚胎发育基因表达图谱,检测出了22,687个母源表达基因,其中包括8,701条长链非编码RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs),比拟于以往通过cDNA微阵列检测出的9,735个母源基因数目大大增添。
北京大学生物动态光学成像中央汤富酬研究员、李瑞强研究员及北京大学第三病院的乔杰教学是该论文的独特通信作者,人力资源管理,闫丽盈博士和在读研究生杨明玉是这篇论文的并列第一作者。该项研究得到了国度重大迷信研究打算和国家天然科学基金的支撑。
? 基因表达图
? 胚胎照片
研究人员还首次将单细胞RNA-Seq高通量测序技术与RNA从头组装生物信息学分析技术相联合,从人类植入前胚胎中发现了两千七百多种全新的lncRNA,其中很多lncRNA表达具备发育阶段特异性,很可能参加了植入前胚胎发育过程中的细胞运气决议。此外,他们还首次检测了建系过程中最早阶段(第0代)的人类胚胎干细胞的转录组,解答了人类囊胚中的上胚层(epiblast)细胞和体外培育的人类胚胎干细胞之间的基因表达模式是否雷同这一由来已久的问题,证明囊胚中的上胚层细胞和建系进程中最早期的人类胚胎干细胞拥有明显不同的转录组,其中有一千四百多个基因显示差别性表达。
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近日,北京大学研究团队采用进步的单细胞RNA-Seq转录组测序技术绘制出了完整的人类植入前胚胎和胚胎干细胞的转录组图谱,这一重要的研究结果发表在9月的《做作构造与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)杂志上。
由一个细胞转录出来的所有RNA称之为转录组,其中包含编码蛋白的RNA跟非编码RNA。对转录组进行正确分析将有助于全面深刻懂得细胞中基因抒发调控的分子机制。转录组分析通常须要几万到多少十万个细胞,然而受人类早期胚胎标本的特别性及起源的限度,人类对本身胚胎的意识及发育机制的懂得极其有限。
研讨职员在国际上首次胜利地分别了囊胚阶段胚胎中的三种细胞(上胚层细胞、原始内胚层细胞、以及滋润外胚层细胞),并进一步剖析其基因表白情形,发明了一批新的细胞分化相干的标记基因。
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编纂:拉丁
在此项研究中,研究人员还将他们采用的单细胞转录组分析技术与国际上比较风行的已经有贸易化试剂盒的Smart-Seq单细胞转录组分析技术进行了体系的比拟,发现本研究组采取的技术在敏锐度、技术稳固性、以及cDNA的全长笼罩平均度等方面均显明优于Smart-Seq技术。
这项研究工作为研究者们供给了一个全面的人类早期胚胎和胚胎干细胞转录组表达网络,对胚胎发育机制的深入研究、胚胎干细胞的认识、人类帮助生殖技巧的保险性评估与改良,以及遗传性疾病的猜测将存在主要的意思及深远的影响。
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