性命迷信学院朱玉贤课题组在《天然?遗传》发表对于亚洲棉基因组

2014-07-03 16:18  北京大学EMBA研修班   未知
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当地时光5月18日,在线出版的《天然?遗传》杂志发表了题为“Genome sequence of the cultivated cotton Gossypium arboreum”的研讨论文,全面报道了性命迷信学院朱玉贤院士跟其研究团队在解析亚洲棉基因组方面获得的最新进展。

通过转录组剖析和大规模基因比较,朱玉贤院士率领的研究团队首次在不同的棉花基因组中发现乙烯信号分子施展了截然相反的作用。他们发现,D基因组过多的乙烯合成克制了棉纤维的发育,而A基因组乙烯的不足导致棉纤维不能充足伸长。抗病基因家族研究显示,相对其近缘种可可,这些基因在对黄萎病有免疫力的D基因组中发生了明显扩大,在A基因组中却发生了显著压缩,北大房地产。此外,大批抗病基因只在D基因组中受黄萎病菌引诱敏捷表白,导致A基因组不能在早期有效响应黄萎病菌的侵染,简直完整损失抗病性。以上研究对于进步棉花产量和纤维品德,加强抗病性都有重要意思。

编纂:歆琴

朱玉贤课题组的博士研究生李钦为独特第一作者。该研究工作受到国家科技部棉花973名目、国家做作科学基金委植物激素重大专项和国度重点试验室基金赞助。

亚洲棉(A基因组)又称树棉,原产于亚洲的热带和亚热带地域,是人类最早种植的农作物之一,同时也是目前世界最主要的经济棉种——海洋棉——的祖先。朱玉贤院士与中国农科院棉花研究所喻树讯院士、深圳华大基因组学研究所配合解析了全长1700兆碱基对的亚洲棉基因组,其中包括41330个蛋白编码基因,基因组大局部(68.5%)由反复序列组成,是到目前为止已测序的双子叶动物中重复序列比例最高的物种。通过与之前(Wang et al., 2012)由同一团队实现的雷蒙德氏棉基因组(D基因组)的比拟,发明A和D基因组在距今约5百万年(2-13百万年)之前从统一先人分化而来,二者的基因数量和基因序列都极为相近,染色体程度上也保存了高度的共线性,但因为A基因组产生过屡次大范围的反转座子插入事件,导致其基因组膨胀至超过D基因组的两倍。上述研究成果将对人类意识棉花基因组的庞杂性和棉属物种进化的多样性发生深远的影响。

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